要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ fgnet”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
从多个注释空间中的富集分析聚类中构建和可视化功能基因和项网络。该软件包包括图形用户界面(GUI)和功能,以通过David,Geneterm Linker,GAGE(GSEA)和TOPGO执行功能丰富分析。
作者:Sara Aibar,Celia Fontanillo,Conrad Droste和Javier de Las Rivas。
维护者:sara aibar
引用(从r内,输入引用(“ fgnet”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
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html | R脚本 | fgnet |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,聚类,,,,功能基因组学,,,,去,,,,基因烯,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 3.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(4年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.15) |
进口 | Igraph(> = 0.6),HWRITER,,,,r.utils,,,,XML,,,,plotrix,,,,RESHAPE2,,,,rcolorbrewer,,,,PNG |
链接 | |
建议 | RGTK2,,,,rcurl,,,,rdavidwebservice,,,,量规,,,,topgo,,,,keggprofile,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,Reactome.db,,,,运行,,,,生物基因,,,,org.sc.sgd.db,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,AnnotationDbi |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.cicancer.org |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | fgnet_3.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | fgnet_3.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | fgnet_3.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fgnet |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fgnet/ |
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