安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ExpressionAtlas”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包是为寻找数据集在EMBL-EBI表达图谱,并下载到R进行进一步分析。每个表达式图谱数据集表示为SimpleList对象每个平台的一个元素。测序数据中包含一个SummarizedExperiment对象,而微阵列数据都包含在一个ExpressionSet或MAList对象。
作者:玛丽亚keay
维护人员:玛丽亚keay < mkeays在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“ExpressionAtlas”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ExpressionAtlas”)
HTML | R脚本 | ExpressionAtlas |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ArrayExpress,ExperimentData,ExpressionData,MicroarrayData,SequencingData,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年) |
许可证 | GPL (> = 3) |
取决于 | R(> = 3.2.0)、方法Biobase,SummarizedExperiment,limma,S4Vectors,xml2 |
进口 | 跑龙套,XML,httr |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | π |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ExpressionAtlas_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ExpressionAtlas_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ExpressionAtlas_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionAtlas |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExpressionAtlas/ |
包下载报告 | 下载数据 |