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DOI:10.18129 / B9.bioc.EnrichmentBrowser

无缝导航结合基于集合的结果和基于网络的富集分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

EnrichmentBrowser包实现基本功能富集分析基因表达数据。分析结合了基于集合的优势和基于网络的基因集富集分析以获得高信任度和生物学通路中不同监管表达数据在调查之中。除此之外,包方便的可视化和探索集和途径。

作者:路德维希Geistlinger Gergely Csaba,拉尔夫·齐默

维护人员:路德维希Geistlinger <路德维希。在bio.ifi.lmu.de Geistlinger >

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browseVignettes (“EnrichmentBrowser”)

PDF	R脚本	EnrichmentBrowser手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,网络,NetworkEnrichment,通路,RNASeq,ReportWriting,软件,可视化
版本	2.6.3
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.0.0),Biobase,GSEABase,pathview
进口	AnnotationDbi,ComplexHeatmap,DESeq2,EDASeq,GO.db,KEGGREST,KEGGgraph,质量,ReportingTools,Rgraphviz,S4Vectors,SPIA,SummarizedExperiment,biocGraph,刨边机,geneplotter,图,hwriter,limma、方法、安全,topGO
链接
建议	所有,BiocStyle,气道,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EnrichmentBrowser_2.6.3.tar.gz
Windows二进制	EnrichmentBrowser_2.6.3.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	EnrichmentBrowser_2.6.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnrichmentBrowser
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EnrichmentBrowser/
包下载报告	下载数据