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DOI:10.18129 / B9.bioc.ENCODExplorer

ENCODE元数据的编译

Bioconductor版本:Release (3.5)

这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据，并允许访问helper函数来查询ENCODE rest api，下载ENCODE数据集，并以SQLite格式保存数据库。

作者:查尔斯·乔利·波帕朗<查尔斯。在crchul.ulaval.ca joly-beauparlant >,Audrey Lemacon , Louis Gendron Astrid-Louise Deschenes, and Arnaud Droit

维护者:查尔斯·乔利·波帕朗<查尔斯。在crchul.ulaval.ca joly-beauparlant >

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“encoexplorer”)

文档

超文本标记语言	R脚本	数据更新
超文本标记语言	R脚本	数据库模型
超文本标记语言	R脚本	介绍ENCODExplorer
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	2.2.1
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3),闪亮的,DT,shinythemes
进口	工具,jsonlite平行,RCurl,tidyr,data.table,dplyr,stringr,stringi
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,旋度,httr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/CharlesJB/ENCODExplorer/issues
取决于我
进口我
建议我	TSRchitect
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ENCODExplorer_2.2.1.tar.gz
Windows二进制	ENCODExplorer_2.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ENCODExplorer_2.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENCODExplorer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorer/
包下载报告	下载数据