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埃尔默

DOI:10.18129 / b9.bioc.elmer

使用癌症甲基瘤推断调节元素景观和转录因子网络

Bioconductor版本:释放(3.5)

ELMER旨在使用来自大量样品的DNA甲基化和基因表达,以在初级组织中提供调节元件景观和转录因子网络。

作者:丽景姚[AUT],Ben Berman [Aut],Peggy Farnham [Aut],Hui Shen [CTB],Peter Laird [CTB],Simon Coetzee [Cre,CTB]

维护者:Simon Coetzee

引文(从R内,输入引文(“埃尔默”)):

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PDF. r script. Elmer:使用甲基瘤推断调节元素景观和转录因子网络
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 德甲基化基因表达Generegulation.主动帆运动软件
版本 1.6.0
在生物导体中以来 BIOC 3.2(R-3.2)(2年)
执照 GPL-3.
依靠 r(> = 3.2.0),illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19homo.sapiens.elmer.data.
进口 方法,生物根系S4Vectors.绞喉Genomeinfodb.Genomicranges.ggplot2.重塑, 网格,格拉底Minfi.基因组法
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源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/elmer.
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