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Bioconductor版本:释放(3.5)
ELMER旨在使用来自大量样品的DNA甲基化和基因表达,以在初级组织中提供调节元件景观和转录因子网络。
作者:丽景姚[AUT],Ben Berman [Aut],Peggy Farnham [Aut],Hui Shen [CTB],Peter Laird [CTB],Simon Coetzee [Cre,CTB]
维护者:Simon Coetzee
引文(从R内,输入引文(“埃尔默”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“ELMER”)
PDF. | r script. | Elmer:使用甲基瘤推断调节元素景观和转录因子网络 |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 德甲基化那基因表达那Generegulation.那主动帆运动那软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.2(R-3.2)(2年) |
执照 | GPL-3. |
依靠 | r(> = 3.2.0),illuminahumanmethylation450kanno.ilmn12.hg19那homo.sapiens.那elmer.data. |
进口 | 方法,生物根系那S4Vectors.那绞喉那Genomeinfodb.那Genomicranges.那ggplot2.那重塑, 网格,格拉底那Minfi.那基因组法 |
链接到 | |
建议 | 平行,雪那生物焦那kn那R.utils.那下载 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | tcgabiolinksgui. |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | Elmer_1.6.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | Elmer_1.6.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | elmer_1.6.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/elmer. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/elmer/ |
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