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DOI:10.18129 / B9.bioc.EGSEA

合奏的基因集富集分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个包实现了合奏的基因集富集分析(EGSEA)基因的方法设置测试。

作者:代孕妈妈Alhamdoosh Milica Ng和马修·里奇

维护人员:妈Alhamdoosh < m。在gmail.com hamdoosh >

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PDF	R脚本	EGSEA装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,微阵列,MultipleComparison,OneChannel,通路,蛋白质组学,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TwoChannel
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),Biobase,计(> = 2.14.4),AnnotationDbi,topGO(> = 2.16.0),pathview(> = 1.4.2)
进口	PADOG(> = 1.6.0),GSVA(> = 1.12.0),globaltest(> = 5.18.0),limma(> = 3.20.9),刨边机(> = 3.6.8),HTMLUtils(> = 0.1.5),hwriter(> = 1.2.2),gplots(> = 2.14.2),ggplot2(> = 1.0.0),安全(> = 3.4.0),stringi(> = 0.5.0)、并行数据,metapgrDevices,图形,跑龙套,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,RColorBrewer、方法、EGSEAdata(> = 1.3.1)
链接
建议	BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	EGSEAdata
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EGSEA_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	EGSEA_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	EGSEA_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EGSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EGSEA/
包下载报告	下载数据