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DOI:10.18129 / B9.bioc.EDDA

实验设计在微分丰度分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

《埃达》可以帮助设计一系列常见的实验如RNA-seq Nanostring化验,RIP-seq和宏基因组测序,使研究人员全面调查实验的影响决策的能力检测微分丰富。这项工作发表在2014年12月3日在标题下基因组生物学”的重要性在高通量检测不同的丰富特性的研究设计实验”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。

作者:李Juntao、罗Huaien Chia Kuan回族伯顿Niranjan纳

维护人员:贾Kuan回族伯顿在gis.a-star.edu.sg > < chiakhb, Niranjan纳< nagarajann在gis.a-star.edu.sg >

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PDF		《埃达》插曲
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,ExperimentalDesign,归一化,RNASeq,测序,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	Rcpp(> = 0.10.4)、并行、方法ROCR,DESeq,baySeq,雪,刨边机
进口	图形、统计、跑龙套、并行、方法ROCR,DESeq,baySeq,雪,刨边机
链接	Rcpp
建议
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增强了
URL	http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EDDA_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	EDDA_1.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	EDDA_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EDDA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EDDA/
包下载报告	下载数据