要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DeepBlueR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
通过R访问深蓝表观遗传学数据服务器。
作者:Felipe Albrecht, Markus List
维护者:Felipe Albrecht < Felipe。albrecht at mpi-inf.mpg.de>, Markus List < Markus。mpi-inf.mpg.de>
引文(从R内,输入引用(“位深蓝”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DeepBlueR”)
超文本标记语言 | R脚本 | 深蓝表观基因组数据服务器- R包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,CpGIsland,DNAMethylation,DataImport,DataRepresentation,表观遗传学,GeneRegulation,GenomeAnnotation,预处理,软件,ThirdPartyClient |
版本 | 1.2.10 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(1年) |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (>= 3.3),XML,RCurl |
进口 | GenomicRanges,data.table,stringr,diffr,dplyr、方法、rjson跑龙套,R.utils,foreach,withr,rtracklayer,GenomeInfoDb,设置,filehash |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,萝拉,Gviz,gplots,ggplot2,tidyr,RColorBrewer,matrixStats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DeepBlueR_1.2.10.tar.gz |
Windows二进制 | DeepBlueR_1.2.10.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DeepBlueR_1.2.10.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeepBlueR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DeepBlueR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |