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DOI:10.18129 / B9.bioc.DSS

用于测序数据的色散收缩。

Bioconductor版本:Release (3.5)

DSS是一个对基于计数的测序数据进行差分分析的R库。它从RNA-seq检测差异表达基因(DEGs)，从亚硫酸氢盐测序(BS-seq)检测差异甲基化位点或区域(DML/DMRs)。DSS的核心是从γ -泊松分布或β -二项分布估计色散参数的一种新的色散收缩方法。

作者:郝武<郝。吴在emory.edu>

维护人员:Hao Wu < Hao。吴在emory.edu>

安装

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文档

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browseVignettes (DSS)

PDF	R脚本	分散收缩RNA-seq数据的差异表达
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DNAMethylation，DifferentialExpression，DifferentialMethylation，GeneExpression，RNASeq，测序，软件
版本	2.16.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(5年)
许可证	GPL
取决于	Biobase，bsseq，样条，方法
进口	DelayedArray
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	DMRcate
进口我
建议我	适当的
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DSS_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	DSS_2.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DSS_2.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DSS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DSS/
软件包下载报告	下载数据