##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DRIMSeq”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.DRIMSeq

rna序列差异转录本使用和dirichlet多项式模型tuQTL分析

Bioconductor版本:Release (3.5)

该包提供了两个框架。一个用于不同条件下的差异转录本使用分析，一个用于tuQTL分析。两者都基于狄利克雷多项式分布的基因组特征(即转录本)计数建模。该包还提供了数据和结果的可视化和探索功能。

作者:Malgorzata Nowicka

维护者:《gosia》。在uzh.ch nowicka >

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DRIMSeq”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DRIMSeq”)

PDF	R脚本	使用DRIMSeq包进行RNA-seq中差异转录本用法和转录本用法QTL分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,遗传学,MultipleComparison,RNASeq,单核苷酸多态性,测序,软件,WorkflowStep
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	跑龙套,统计数据,质量,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,BiocGenerics、方法、BiocParallel,limma,刨边机,ggplot2,reshape2
链接
建议	PasillaTranscriptExpr,GeuvadisTranscriptExpr、网格BiocStyle,knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DRIMSeq_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	DRIMSeq_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DRIMSeq_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DRIMSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DRIMSeq/
包下载报告	下载数据