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Desubs
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doi：10.18129/b9.bioc.desubs
Desubs：使用RNA-Seq表达实验灵活识别差异表达的子路的R包装
生物导体版本：版本（3.5）
Desubs是一个基于网络的系统生物学软件包，该软件包在RNA-Seq实验记录的路径网络中提取疾病扰动的子路。它包含一个广泛且可定制的框架，涵盖了子路口分析的各个阶段的广泛操作模式，从而实现了特定于案例的方法。操作模式是指有关各种生物学和药理特征的路径网络构建和处理，子路口提取，可视化和富集分析。它的功能使其成为建模者和实验者的工具指导，以识别更健壮的系统级生物标志物来用于复杂疾病。
作者：Aristidis G. Vrahatis和Panos Balomenos
维护者：Aristidis G. Vrahatis
引用（从r内，输入引用（“ Desubs”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Desubs”）
| R脚本 | Desubs | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，kegg，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，正常化，，，，途径，，，，rnaseq，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 1.2.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.3），Locfit |
| 进口 | 图形，，，，Igraph，，，，rbgl，，，，循环，，，，林玛，，，，EDGER，，，，萨姆，，，，EBSEQ，，，，NBPSEQ，，，，deseq，统计，grdevices，图形，pheatmap，utils，GGPLOT2，，，，矩阵，，，，jsonlite， 工具，deseq2， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Desubs_1.2.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | Desubs_1.2.2.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Desubs_1.2.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/desubs |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/desubs/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
