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DOI:10.18129 / B9.bioc.DEGreport

DEG分析报告

Bioconductor版本:Release (3.5)

创建计数数据差异表达式分析的HTML报告。它集成了DESeq2和edgeR小插图中提到的一些代码，并根据每个选定基因的折叠变化平均值和变异性报告了一个排序的基因列表。

作者:Lorena Pantano [aut, cre]， John Hutchinson [ctb]， Victor Barrera [ctb]， Mary Piper [ctb]

维护者:Lorena Pantano < Lorena。Pantano在gmail.com>

安装

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文档

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PDF	R脚本	DEGreport
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，ReportWriting，软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(三年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (>= 3.2.0)，quantreg
进口	跑龙套、方法ggplot2，ggrepel，喷嘴。R1，coda，刨边机，集群，日志记录，dplyr，tidyr，重塑，pheatmap、网格gridExtra，knitr， grDevices, stats
链接
建议	biomaRt，RUnit，BiocStyle，BiocGenerics，org.Hs.eg.db，DESeq2，AnnotationDbi，BiocParallel
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DEGreport_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	DEGreport_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DEGreport_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEGreport
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEGreport/
软件包下载报告	下载数据