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DOI:10.18129 / B9.bioc.CountClust

集群使用会员等级和可视化RNA-Seq表达数据模型

Bioconductor版本:版本(3.5)

适合会员等级模型(傻子,也被称为混合模型)集群RNA-seq基因表达计数数据,识别特征基因推动集群成员,并提供了一个视觉的集群成员。

作者:Kushal戴伊(aut (cre),乔伊斯·萧(aut),马修·斯蒂芬斯(aut)

维护人员:Kushal戴伊< kkdey uchicago.edu >

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browseVignettes (“CountClust”)

PDF	R脚本	会员等级聚类并使用CountClust可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod,可视化
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3.0),ggplot2(> = 2.1.0的)
进口	maptpx,大满贯,plyr(> = 1.7.1上),cowplot,gtools,flexmix,激情似火,limma平行,reshape2统计,跑龙套,图形,grDevices
链接
建议	knitr,BiocStyle,Biobase,roxygen2,RColorBrewer,devtools,xtable
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/CountClust
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CountClust_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	CountClust_1.3.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CountClust_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CountClust
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CountClust/
包下载报告	下载数据