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DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

使复杂的热图

Bioconductor版本:版本(3.5)

复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的结构。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图,支持自定义注释图形。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ComplexHeatmap”)

文档

HTML	R脚本	1。介绍ComplexHeatmap包
HTML	R脚本	2。做一个热图
HTML	R脚本	3所示。制作的热图的列表
HTML	R脚本	4所示。热图注释
HTML	R脚本	5。热图和注释的传说
HTML	R脚本	6。热图装饰
HTML	R脚本	7所示。互动与热图
HTML	R脚本	8。OncoPrint
HTML	R脚本	9。更多的例子
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.1.2)、网格图形、属性、grDevices
进口	方法,circlize(> = 0.3.4),GetoptLong,色彩,RColorBrewer,dendextend(> = 1.0.1),GlobalOptions(> = 0.0.10)
链接
建议	testthat(> = 0.3),knitr,减价,集群,质量,pvclust,dendsort,HilbertCurve,开罗,png,jpeg,tiff,fastcluster
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmap
取决于我	EnrichedHeatmap,收回
进口我	EnrichmentBrowser,fCCAC,ImpulseDE2,maftools,TCGAbiolinks,YAPSA
建议我	gtrellis,HilbertCurve
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ComplexHeatmap_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	ComplexHeatmap_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	ComplexHeatmap_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
包下载报告	下载数据