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芝加哥

DOI:10.18129 / b9.bioc.chicago.

芝加哥:基因组组织的捕获Hi-C分析

Bioconductor版本:释放(3.5)

用于分析捕获Hi-C数据的管道。

作者:乔纳森凯恩斯,宝拉弗雷·普雷特,史蒂文·飞贝特,米哈伊特斯皮克罗夫

维护者:Mikhail Spivakov

引文(从R内,输入引文(“芝加哥”)):

安装

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HTML. r script. 芝加哥小插图
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细节

Biocviews. 表观遗传学测序软件
版本 1.4.0
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(1.5岁)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.2),data.table.
进口 MatrixStats.大量的HMISC.delaporte.,方法,grdevices,图形,统计数据,utils
链接到
建议 argparser.生物焦knRAMAMAMDOW.pchicdata.testthat.RSAMTOOLS.基因组互动Genomicranges.绞喉annotationhub.
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源包 Chicago_1.4.0.tar.gz.
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源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/chicago.
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