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chipseqr

doi:10.18129/b9.bioc.chipseqr

在高通量测序数据中识别蛋白质结合位点

生物导体版本:版本(3.5)

CHIPSEQR鉴定了CHIP-SEQ和核小体定位实验的蛋白质结合位点。用于描述结合事件的模型是为定位核小体而开发的,但也应足够灵活以处理其他类型的实验。

作者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

维护者:彼得·洪堡(Peter Humburg)

引用(从r内,输入引用(“ chipseqr”)):

安装

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PDF R脚本 Chipseqr简介
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(8年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.10.0),方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25)
进口 生物弦,,,,FBASICS,,,,基因组机,,,,iranges(> = 2.5.14),图形,grdevices,希尔伯特维斯,,,,Shortread,统计蒂姆萨克,UTILS
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源包 chipseqr_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 chipseqr_1.30.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) chipseqr_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqr/
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