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chipxpress

doi:10.18129/b9.bioc.chipxpress

Chipxpress:使用公开可用的基因表达曲线从芯片序列和芯片芯片数据中鉴定的转录因子靶基因鉴定增强

生物导体版本:版本(3.5)

Chipxpress从CHIPX数据中采用预测的TF结合基因,并使用从NCBI GEO下载的相应基因表达剖面数据库来对TF结合目标进行排名,以使其最有可能是功能性TF目标的顺序。

作者:乔治·吴

维护者:jhsph.edu> george wu

引用(从r内,输入引用(“ chipxpress”)):

安装

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browsevignettes(“ chipxpress”)

PDF R脚本 chipxpress
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,芯片,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.10),chipxpressdata
进口 生物酶,,,,地球,,,,FRMA,,,,副词,,,,BigMemory,,,,biganalytics
链接
建议 Mouse4302frmavecs,,,,鼠标4302.DB,,,,鼠标4302CDF,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
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建议我
构建报告

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源包 chipxpress_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan) chipxpress_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipxpress
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chipxpress/
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