要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("CancerSubtypes")

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CancerSubtypes

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerSubtypes

基于基因组数据的癌症亚型识别、验证和可视化

Bioconductor版本:Release (3.5)

CancerSubtypes整合了目前常见的癌症亚型识别计算生物学方法,并提供了基于基因组数据集的癌症亚型分析的标准化框架。

作者:徐桃生<陶生。X在gmail.com>,Thuc Le

维护人员:徐涛声<涛声。X在gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“CancerSubtypes”)):

安装

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##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("CancerSubtypes")

文档

超文本标记语言 R脚本 CancerSubtypes
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件可视化
版本 1.2.5
在Bioconductor公司 BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.4),sigclustNMF
进口 SNFtooliCluster生存集群嫁祸于limmaConsensusClusterPlus, grDevices
链接
建议 BiocGenericsknitrRTCGA.mRNARTCGA.clinical
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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构建报告

包档案

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源包 CancerSubtypes_1.2.5.tar.gz
Windows二进制 CancerSubtypes_1.2.5.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) CancerSubtypes_1.2.5.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/CancerSubtypes
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerSubtypes/
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