# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“CNPBayes”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNPBayes

贝叶斯混合模式拷贝数多态性

Bioconductor版本:版本(3.5)

贝叶斯分层混合模型对批处理效果和拷贝数。

作者:斯蒂芬•克里斯蒂罗伯特•Scharpf雅各凯里

维修工:雅各凯里< jcarey15 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“CNPBayes”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CNPBayes”)

PDF	R脚本	确定拷贝数多态性
PDF	R脚本	拷贝数估计的贝叶斯混合模型的实现
PDF	R脚本	概述CNPBayes包
PDF	R脚本	概述CNPBayes包
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯,CopyNumberVariation,软件
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.1),S4Vectors(> = 0.9.25),matrixStats,RColorBrewer,gtools,combinat,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges、方法、BiocGenerics、图表、数据、coda,SummarizedExperiment
链接	Rcpp
建议	testthat,knitr,BiocStyle,VanillaICE(> = 1.31.3),BiocCheck,质量,oligoClasses,dplyr,tidyr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/scristia/CNPBayes
BugReports	https://github.com/scristia/CNPBayes/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CNPBayes_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	CNPBayes_1.6.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	CNPBayes_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNPBayes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CNPBayes/
包下载报告	下载数据