要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("BubbleTree")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

BubbleTree

DOI:10.18129 / B9.bioc.BubbleTree

利用下一代测序数据阐明体细胞嵌合体中的肿瘤非整倍性和克隆性的直观可视化

Bioconductor版本:Release (3.5)

各组肿瘤样本CNV分析。

作者:Wei Zhu , Michael Kuziora , Todd Creasy , Brandon Higgs

维护者:Todd Creasy , Wei Zhu , Kui Shen

引用(从R中,输入引用(“BubbleTree”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("BubbleTree")

文档

超文本标记语言 R脚本 BubbleTree教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation报道测序软件
版本 2.6.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年)
许可证 LGPL (> = 3)
取决于 R (> = 3.3),IRangesGenomicRangesplyrdplyrmagrittr
进口 BiocGenerics(> = 0.7.5),BiocStyleBiobaseggplot2WriteXLSgtoolsRColorBrewerlimma、网格gtablegridExtrabiovizBasee1071,方法,grDevices, stats, utils
链接
建议 knitrrmarkdown
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 BubbleTree_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 BubbleTree_2.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) BubbleTree_2.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BubbleTree
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BubbleTree/
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