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Aneufinder
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doi：10.18129/b9.bioc.aneufinder
分析单细胞序列数据中的拷贝数变化
生物导体版本：版本（3.5）
该软件包实现了来自全基因组单细胞测序数据的CNV调用，绘制，导出和分析的功能。
作者：Aaron Taudt，Bjorn Bakker，David Porubsky
维护者：aaron taudt
引用（从r内，输入引用（“ Aneufinder”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Aneufinder”）
| R脚本 | 快速介绍Aneufinder | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，基因组变量，，，，HiddenMarkovModel，，，，软件，，，，全媒体 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（1。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3），基因组机，，，，牛仔图，，，，Aneufinderdata |
| 进口 | 方法，UTILS，GRDEVICES，图形，统计信息，foreach，，，，多帕尔，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，bamsignals，，，，DNACOPIGY，，，，生物弦，，，，基因组签名，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2，，，，ggdendro，，，，Ggrepel，，，，重新排序，，，，mclust |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ataudt/aneufinder.git |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Aneufinder_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | aneufinder_1.4.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Aneufinder_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aneufinder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/aneufinder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
