##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" allelic失衡")

DOI:10.18129 / B9.bioc.AllelicImbalance

研究等位基因特异性表达

Bioconductor版本:Release (3.5)

提供了使用RNA-seq数据进行等位基因特异性表达调查的框架。

作者:Jesper R Gadin, Lasse Folkersen

维护者:Jesper R Gadin

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" allelic失衡")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“AllelicImbalance”)

PDF	R脚本	AllelicImbalance装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，基础设施，测序，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.2.0)，网格，GenomicRanges，SummarizedExperiment(> = 0.2.0),GenomicAlignments
进口	方法,BiocGenerics，AnnotationDbi，BSgenome，VariantAnnotation，Biostrings，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，Rsamtools，GenomicFeatures，Gviz，晶格，latticeExtra，gridExtra，seqinr，GenomeInfoDb，nlme
链接
建议	testthat，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance
BugReports	https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	AllelicImbalance_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	AllelicImbalance_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	AllelicImbalance_1.14.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/AllelicImbalance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AllelicImbalance/
软件包下载报告	下载数据