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DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

利用RNA-Seq分析替代剪接

Bioconductor版本:Release (3.5)

利用RNA-seq分析替代剪接的综合管道。

作者:艾斯特法尼亚·曼奇尼，马塞洛·亚诺夫斯基，阿里尔·切尔诺莫雷茨

维护者:Estefania Mancini ， Javier Iserte

安装

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文档

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browseVignettes(“ASpli”)

PDF	R脚本	基于ASpli的可选拼接分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，GenomeAnnotation，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录
版本	1.2.4
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel
进口	DESeq2，DEXSeq，GenomicRanges，GenomicFeatures，刨边机，BiocGenerics，IRanges，GenomicAlignments，Gviz，S4Vectors，AnnotationDbi，limma
链接
建议	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_1.2.4.tar.gz
Windows二进制	ASpli_1.2.4.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ASpli_1.2.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据