curatedCRCData是结肠直肠癌转录组临床导向研究的综合资源。它提供了临床注释的表达数据,包括癌症基因组图谱(TCGA) RNASeqV2和Agilent mRNA微阵列数据集。通过最新的地图,探测器被映射到官方的基因符号上。所有临床注释都是手工管理和机器检查的,以确保语法一致和最大限度地保留可用的临床变量。ExpressionSet槽中填充了大量的元数据,包括PubMed id、引文、摘要、针对撤回和重复样本的研究特定警告,以及probeset <——>基因图。package vignette提供了一些示例,用于基于灵活的规则选择患者和数据集,执行潜在生物标记的元分析,从ExpressionSet元数据创建可发布的表,以及为非r用户简单导出数据表。