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此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见systemPipeRdata。

systemPipeRdata: NGS工作流模板和示例数据

Bioconductor版本:3.4

systemPipeRdata是一个帮助包，用一个命令NGS工作流模板生成，这些模板被它的父包systemPipeR使用。后者是为下一代序列(NGS)应用程序(如RNA-Seq、RIBO-Seq、ChIP-Seq、VAR-Seq等)构建端到端分析管道的自动化报告生成环境。systemPipeR的概述小插图中给出了使用systemPipeRdata的详细示例。

作者:托马斯Girke

维护者:Thomas Girke < Thomas。在ucr.edu girke >

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	概述装饰图案
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,ChIPSeq,报道,DataImport,ExperimentData,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,基础设施,MethylSeq,质量控制,RNASeq,单核苷酸多态性,测序
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	BiocGenerics
链接
建议	RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,systemPipeR
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tgirke/systemPipeRdata
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	systemPipeRdata_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/systemPipeRdata/
包下载报告	下载数据