##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("parathyroidSE")

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本，请参见parathyroidSE．

Haglund等人对甲状旁腺肿瘤原代培养物RNA-Seq的实验总结，临床内分泌杂志，2012。

Bioconductor版本:3.4

这个包提供了从甲状旁腺肿瘤原代培养实验中获得的成对端RNA-Seq数据在基因和外显子部分的读取计数的rangedsummarized实验对象。资料发表于Haglund F、Ma R、Huss M、Sulaiman L、Lu M、Nilsson IL、Hoog a、Juhlin CC、Hartman J、Larsson C、J Clin Endocrinol Metab的文章《甲状旁腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据》。jc。2012-2484, Epub 2012年9月28日，PMID: 23024189。对4例患者在3种情况(DPN、OHT和对照组)的2个时间点的肿瘤培养物进行测序。一个对照样本由于质量不高而被论文作者遗漏。包小插图描述了从NCBI基因表达Omnibus在登录号GSE37211下提供的原始测序数据创建对象。基因和外显子特征是GRCh37 ensemble的注释。

作者:迈克尔的爱

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("parathyroidSE")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“parathyroidSE”)

PDF	R脚本	parathyroidGenesSE
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，RNASeqData，SequencingData
版本	1.12.0
许可证	LGPL
取决于	SummarizedExperiment， r (>= 2.10)
进口
链接
建议	Rsamtools，GenomicAlignments，GEOquery，SRAdb，GenomicFeatures，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	ClassifyR，DEXSeq，simulatorZ
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	parathyroidSE_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/parathyroidSE/
包下载报告	下载数据