要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RforProteomics”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见RforProteomics.
Bioconductor版本:3.4
该软件包包含代码来说明“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”论文。两个小插图描述了再现论文中描述的示例和图形以及蛋白质组学可视化功能所需的代码和数据。
作者:Laurent Gatto [aut, cre], Thomas Lin Pedersen [ctb], Sebastian Gibb [ctb], Vlad Petyuk [ctb]
维护者:Laurent Gatto
引文(从R内,输入引用(“RforProteomics”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RforProteomics”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RforProteomics”)
R脚本 | 用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析的现状展望 | |
R脚本 | RforProteomics Bioc2013海报 | |
R脚本 | 用R进行蛋白质组学数据分析 | |
超文本标记语言 | 使用R和Bioconductor可视化蛋白质组学数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,MassSpectrometryData,ReproducibleResearch |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | MSnbase |
进口 | R.utils,Biobase,rpx,biocViews,BiocInstaller,interactiveDisplay,闪亮的 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,mzR,xcms,msdata,等压线,MALDIquant(> = 1.12),MALDIquantForeign,readBrukerFlexData,rTANDEM,synapter,synapterdata,IPPD,Rdisop,OrgMassSpecR,大脑,的方式,hpar,GO.db,org.Hs.eg.db,biomaRt,RColorBrewer,ggplot2,reshape2,xtable,晶格,mzID,pRoloc,pRolocdata,MSGFplus,MSGFgui,MSnID,msmsTests,msmsEDA,corrplot,Heatplus,gplots,维恩图,genefilter |
SystemRequirements | |
增强了 | 切肉刀 |
URL | http://lgatto.github.com/RforProteomics/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | proteoQC,qcmetrics |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RforProteomics_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RforProteomics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |