要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rnaseqdata.hhnrnpc.bam.chr14”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14

RNASEQ实验的对齐读数:通过HNRNPC敲低和控制HeLa细胞的高通量测序进行转录分析

生物导体版本:3.4

该软件包包含8个BAM文件,每次测序运行1个。每个BAM文件是通过(1)将读取(配对端)与TopHat2的完整HG19基因组对齐的,然后(2)子集将读取(配对端)对齐以保持CHR14的比对。有关该实验的详细信息,请参见ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147,包括指向已发表研究的链接(Zarnack等,2012)和FastQ文件。

作者:H。页面

维护者:H。页面>

引用(从r内,输入引用(“ rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rnaseqdata.hhnrnpc.bam.chr14”)

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 ArrayExpress,,,,实验数据,,,,地理,,,,基因组,,,,homo_sapiens_data,,,,NCI,,,,rnaseqdata,,,,序列数据
版本 0.12.0
执照 LGPL
要看
进口
链接
建议 基因组签名,,,,Biocinstaller
系统要求
增强
URL http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/e-mtab-1147/
取决于我
进口我
建议我 阿斯普利,,,,生物比较,,,,基因组签名,,,,Genomicfiles,,,,基因组机,,,,怒吼,,,,rsamtools,,,,剪接图
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14_0.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14/
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