要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rnaseqdata.hhnrnpc.bam.chr14”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14。
生物导体版本:3.4
该软件包包含8个BAM文件,每次测序运行1个。每个BAM文件是通过(1)将读取(配对端)与TopHat2的完整HG19基因组对齐的,然后(2)子集将读取(配对端)对齐以保持CHR14的比对。有关该实验的详细信息,请参见ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147,包括指向已发表研究的链接(Zarnack等,2012)和FastQ文件。
作者:H。页面
维护者:H。页面
引用(从r内,输入引用(“ rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rnaseqdata.hhnrnpc.bam.chr14”)
参考手册 |
生物浏览 | ArrayExpress,,,,实验数据,,,,地理,,,,基因组,,,,homo_sapiens_data,,,,NCI,,,,rnaseqdata,,,,序列数据 |
版本 | 0.12.0 |
执照 | LGPL |
要看 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | 基因组签名,,,,Biocinstaller |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/e-mtab-1147/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 阿斯普利,,,,生物比较,,,,基因组签名,,,,Genomicfiles,,,,基因组机,,,,怒吼,,,,rsamtools,,,,剪接图 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14_0.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |