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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见PGPC．

HCT116等基因细胞系化学-遗传交互筛选的实验数据和分析

Bioconductor版本:3.4

该软件包包含实验数据和小插图，指导分析等基因HCT116细胞系中的化学-遗传相互作用筛选。该代码可用于生成“在癌细胞中使用高通量成像的小分子化学-遗传相互作用图”手稿的所有结果和数字，该手稿已被《分子系统生物学》杂志接受出版。数据可用性:此数据集的补充视图可通过不同的存储库获得。图像数据文件可从欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的生物研究数据库中获得，编号为S-BSMS-PGPC1 (http://wwwdev.ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-BSMS-PGPC1)。用于探索图像的交互式前端由IDR数据库http://dx.doi.org/10.17867/10000101提供。作者在http://dedomena.embl.de/PGPC上创建了一个交互式网页来浏览图片和交互配置文件。

作者:菲利克斯·克莱因

维护者:Felix Klein < Felix。克莱因在embl.de>

安装

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文档

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browseVignettes(“PGPC”)

PDF	R脚本	PGPC
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CancerData，ColonCancerData，ExperimentData
版本	1.2.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.0)，EBImage，imageHTS，SearchTrees，limma，RColorBrewer，gplots，splots，ggplot2，geneplotter，ChemmineR，reshape2，plyr
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	PGPC_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PGPC/
软件包下载报告	下载数据