安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GSE62944”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSE62944。
Bioconductor版本:3.4
TCGA RNA-Seq数据处理9264肿瘤和741年24正常样本的癌症类型,使他们可以加入地理(GSE62944) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62944)。GSE62944数据解析成ExperimentHub SummarizedExperiment对象可用。
作者:Sonali Arora
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“GSE62944”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GSE62944”)
HTML | R脚本 | 使用Bioconductor ExperimentHub TCGA的原始数据 |
参考手册 |
biocViews | DNASeqData,ExperimentData,基因组,RNASeqData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,GEOquery |
进口 | |
链接 | |
建议 | ExperimentHub(> = 0.99.6),knitr,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/GSE62944.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GSE62944_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSE62944/ |
包下载报告 | 下载数据 |