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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119．

智人的SNP位点(dbSNP Build 135)

Bioconductor版本:3.4

从NCBI dbSNP Build 135中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2011年11月18日至19日创建，包含映射到参考基因组GRCh37.p5的snp。警告:请注意，GRCh37。p5基因组是GRCh37的补丁版本，但补丁不会改变染色体1-22,X, Y, MT。GRCh37本身与UCSC的hg19基因组*相同*除了线粒体染色体。因此，该包中的snp可以被“注入”到bsgenome . hspiens . ucsc中。hg19，它们将降落在正确的位置，但这种注入将排除chrM(即没有任何东西将以该顺序注入)。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens
版本	0.99.7
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，IRanges，GenomicRanges
进口	方法,S4Vectors，IRanges，GenomicRanges
链接
建议	Biostrings，BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	FDb.UCSC.snp135common.hg19

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119_0.99.7.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119/
软件包下载报告	下载数据