要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506

智人的SNP位点(dbSNP Build 130)

Bioconductor版本:3.4

从NCBI dbSNP Build 130中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2009年5月5日至6日创建,包含映射到参考基因组NCBI Build 36.1的snp,该基因组与UCSC的hg18基因组相同。因此,该包中的snp可以被“注入”到bsgenome . hspiens . ucsc中。Hg18,他们会降落在正确的位置。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

引文(从R内,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiens
版本 0.99.9
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),IRangesGenomicRangesBSgenome(> = 1.25.6)
进口 方法,跑龙套,IRangesGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18(> = 1.3.19)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506_0.99.9.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506/
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