# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“trackViewer”)

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅trackViewer。

bioconductor包与极简设计优雅的追踪和棒棒糖

Bioconductor版本:3.4

可视化映射读取连同注释作为门店的数据集,如ChIP-seq追踪层,RNA-seq, miRNA-seq DNA-seq、单核苷酸多态性和甲基化数据。

作者:Jianhong Ou,咏Wang丽华朱莉朱

维护人员:Jianhong Ou <,或者在umassmed.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“trackViewer”)

文档

HTML	R脚本	trackViewer装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件,可视化
版本	1.10.2
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.1.0), grDevices,方法,GenomicRanges、网格
进口	GenomicAlignments,GenomicFeatures,Gviz,pbapply,Rsamtools,rtracklayer,S4Vectors,尺度、工具、IRanges,AnnotationDbi,grImport
链接
建议	biomaRt,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,RUnit,org.Hs.eg.db,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	彗星
进口我
建议我	ChIPpeakAnno
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	trackViewer_1.10.2.tar.gz
Windows二进制	trackViewer_1.10.2.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	trackViewer_1.10.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/trackviewer/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trackViewer/
包下载报告	下载数据