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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见tofsims．

飞行时间次级离子质谱(ToF-SIMS)成像数据的导入、处理和分析

Bioconductor版本:3.4

该软件包提供了ToF-SIMS 2D图像数据导入、处理和分析的管道。支持Iontof和ulac - phi导入原始数据或预处理数据。对于原始数据，存在质量校准、峰值选取和峰值积分。一般功能包括数据分箱，缩放，图像子集和可视化。实现了ToF-SIMS社区中常见的一系列多元工具(PCA, MCR, MAF, MNF)。生物导体图像处理包EBImage的接口提供了图像分割功能。

作者:Lorenz Gerber, Viet Mai Hoang

维护者:Lorenz Gerber

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	使用' tofsims '包的工作流
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImagingMassSpectrometry，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.3.0)，方法，utils，ProtGenerics
进口	Rcpp(> = 0.11.2),肌萎缩性侧索硬化症，ChemometricsWithR，信号，KernSmooth，图形，grDevices，统计
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	EBImage，knitr，rmarkdown，testthat，tofsimsData，BiocParallel，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了	平行
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	tofsims_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	tofsims_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	tofsims_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/tofsims/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tofsims/
软件包下载报告	下载数据