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此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见tigre。

通过高斯过程来推断转录因子

Bioconductor版本:3.4

tigre软件包实现了我们的高斯过程微分方程模型的方法，用于分析来自单输入motif网络的基因表达时间序列。该包可用于从已知靶基因的表达测量推断未观察到的转录因子(TF)蛋白浓度，或对TF的候选靶标进行排序。

作者:Antti Honkela, Pei Gao, Jonatan Ropponen, Miika-Petteri Matikainen, Magnus Rattray, Neil D. Lawrence

维护者:安蒂·洪凯拉<安蒂。在hiit.fi honkela >

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

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文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tigre”)

PDF	R脚本	tigre快速指南
PDF	R脚本	tigre用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,GeneRegulation,微阵列,NetworkInference,软件,TimeCourse,转录
版本	1.28.1
Bioconductor自	BioC 2.6 (R-2.11)(7年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 2.11.0),BiocGenerics,Biobase
进口	方法,AnnotationDbi,gplots，图像，统计，效用，注释,DBI,RSQLite
链接
建议	drosgenome1.db,彪马,光民,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ahonkela/tigre
BugReports	https://github.com/ahonkela/tigre/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	tigre_1.28.1.tar.gz
Windows二进制	tigre_1.28.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	tigre_1.28.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/tigre/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tigre/
包下载报告	下载数据