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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见synapter．

无标签数据分析管道，优化识别和定量

Bioconductor版本:3.4

synapter包提供了重新分析Synapt G2质谱仪上获得的无标签蛋白质组学数据的功能。一次或几次运行，可能与额外的离子迁移分离处理，以提高识别精度，可以结合到其他定量文件，以最大限度地提高识别和定量精度。

作者:劳伦特·盖托，尼克·j·邦德，帕维尔·v·什里亚哈和塞巴斯蒂安·吉布。

维护者:Laurent Gatto 和塞巴斯蒂安·吉布<邮件在sebastiangibb.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“突触”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“synapter”)

PDF	R脚本	使用“突触”结合HDMSe/MSe数据以优化识别和定量
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.15)，方法，MSnbase
进口	hwriter，RColorBrewer，晶格，qvalue，乘跑龙套,Biobase，knitr，Biostrings，切肉刀，BiocParallel
链接
建议	synapterdata，xtabletcltk,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://lgatto.github.com/synapter/
全靠我	synapterdata
进口我
建议我	pRoloc，RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	synapter_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	synapter_1.16.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	synapter_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/synapter/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/synapter/
软件包下载报告	下载数据