要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“snpStats”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

snpStats

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见snpStats

SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.4

大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:David Clayton

维护者:David Clayton

引文(从R内,输入引用(“snpStats”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“snpStats”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“snpStats”)

PDF R脚本 数据输入
PDF R脚本
PDF R脚本 归因和元分析
PDF R脚本 LD统计
PDF R脚本 主成分分析
PDF snpMatrix-differences
PDF R脚本 snpStats介绍
PDF R脚本 TDT)测试
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneticVariability微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10.0),生存矩阵、方法
进口 图形,grDevices,统计,utils,BiocGenericszlibbioc
链接
建议 hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GGBaseGGdata
进口我 FunciSNPGeneGeneInteRGGtoolsgQTLstatsgwascatldblock
建议我 crlmmGWASToolsVariantAnnotation
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 snpStats_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 snpStats_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) snpStats_1.24.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/snpStats/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网