要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“snpStats”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见snpStats.
Bioconductor版本:3.4
大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包,允许基因型的不确定性。
作者:David Clayton
维护者:David Clayton
引文(从R内,输入引用(“snpStats”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“snpStats”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“snpStats”)
R脚本 | 数据输入 | |
R脚本 | 置 | |
R脚本 | 归因和元分析 | |
R脚本 | LD统计 | |
R脚本 | 主成分分析 | |
snpMatrix-differences | ||
R脚本 | snpStats介绍 | |
R脚本 | TDT)测试 | |
参考手册 |
biocViews | GeneticVariability,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10.0),生存,矩阵、方法 |
进口 | 图形,grDevices,统计,utils,BiocGenerics,zlibbioc |
链接 | |
建议 | hexbin |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | GGBase,GGdata |
进口我 | FunciSNP,GeneGeneInteR,GGtools,gQTLstats,gwascat,ldblock,餐 |
建议我 | crlmm,GWASTools,VariantAnnotation |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | snpStats_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | snpStats_1.24.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | snpStats_1.24.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/snpStats/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |