要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“simpleaffy”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅simpleaff.。
Bioconductor版本:3.4
提供高级别的函数来读取贴心.cel文件,表型数据,然后用它计算简单的东西,例如t-tests,折叠变化等。大量使用贴心图书馆。还具有一些基本散点图功能和机制,用于生成高分辨率期刊数据......
作者:Crispin J Miller
维护者:Crispin Miller
引文(从R内,输入引文(“simpleaffy”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“simpleaffy”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“SimpleAffy”)
PDF. | r script. | SimpleAffy Primer. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 自述 |
Biocviews. | 注解那DataImport.那不同的亚兴那微阵列那oneChannel.那预处理那QualityControl.那报告写作那软件那转录那可视化 |
版本 | 2.50.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 1.6(R-2.1)或更早(> 12年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.0.0),方法,UTI,GRDEVICE,图形,统计数据,生物根系(> = 0.1.12),BioBase.那敬服(> = 1.33.6),Genefilter.那Gcrma. |
进口 | 方法,Utils,Grdevices,图形,统计数据,生物根系那BioBase.那敬服那Genefilter.那Gcrma. |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://www.biocadiond.org.http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
取决于我 | YaqCaffy. |
进口我 | affyqcreport.那Arraymvout. |
建议我 | yeasyExpress那ArrayTools.那弯头 |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | simpleaffy_2.50.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | simpleaffy_2.50.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.9(mavericks) | simpleaffy_2.50.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondion-mirror/simpleaffy/tree/release-3.4 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/simpleaffy/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |