要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("shinyMethyl")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

shinyMethyl

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见shinyMethyl

Illumina甲基化阵列的交互式可视化

Bioconductor版本:3.4

可视化Illumina甲基化阵列数据的交互式工具。同时支持450k和EPIC阵列。

作者:Jean-Philippe Fortin [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Jean-Philippe Fortin

引用(从R中,输入引用(“shinyMethyl”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("shinyMethyl")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“shinyMethyl”)

PDF R脚本 shinyMethyl: Illumina 450K甲基化阵列的交互式可视化
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.10.0
在Bioconductor公司 BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifestmatrixStats, r (>= 3.0.0)
进口 RColorBrewer
链接
建议 shinyMethylDataminfiDataBiocStyleRUnit消化knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 shinyMethyl_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 shinyMethyl_1.10.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) shinyMethyl_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/shinyMethyl/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
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