要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“scran”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

食物

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见食物

单细胞rna序列数据分析方法

Bioconductor版本:3.4

实现各种单细胞RNA-seq数据的低级分析。方法提供了标准化的细胞特异性偏差,细胞周期阶段的分配,并检测高变量和显著相关的基因。

作者:Aaron Lun [aut, cre], Karsten Bach [aut], Jong Kyoung Kim [ctb], Antonio Scialdone [ctb]

维护者:Aaron Lun

引文(从R内,输入引用(“残渣”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“scran”)

文档

超文本标记语言 R脚本 使用scran对单细胞RNA-seq数据进行基本分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression归一化RNASeq测序SingleCell软件转录组
版本 1.2.2
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3.0),BiocParallel
进口 dynamicTreeCut动物园刨边机统计数据,BiocGenerics、方法、Biobase跑龙套,矩阵闪亮的,图形,grDevices,statmod
链接
建议 limSolvelimmatestthatknitrBiocStyleorg.Mm.eg.dbDESeq2单片眼镜S4Vectorsggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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建议我 SIMLR
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 scran_1.2.2.tar.gz
Windows二进制 scran_1.2.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) scran_1.2.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/scran/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scran/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网