要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ scater”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅评分。
生物导体版本:3.4
一系列用于对单细胞RNA-seq基因表达数据进行各种分析的工具,重点是质量控制。
作者:戴维斯·麦卡锡
维护者:戴维斯·麦卡锡(Davis McCarthy)
引用(从r内,输入引用(“ spater”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ scater”)
html | R脚本 | SCATER包装的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,维度,,,,基因表达,,,,基础设施,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.3),生物酶,,,,GGPLOT2, 方法 |
进口 | Biomart,,,,生物基因,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,EDGER,,,,ggbeeswarm, 网格,林玛,,,,矩阵, 平行,plyr,,,,RESHAPE2,,,,RHDF5,,,,rjson,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,统计tximport,,,,维里迪斯 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,牛仔图,,,,簇,,,,命运,,,,尼特,,,,单片,,,,mvoutlier,,,,rmarkDown,,,,RTSNE,,,,测试,,,,马格里特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/davismcc/scater |
BugReports | https://github.com/davismcc/scater/issues |
取决于我 | 斯克兰 |
进口我 | SC3 |
建议我 | switchde |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | scater_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | scater_1.2.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | scater_1.2.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/scater/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scater/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |