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评分

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅评分

用于R中基因表达数据的单细胞分析工具包

生物导体版本:3.4

一系列用于对单细胞RNA-seq基因表达数据进行各种分析的工具,重点是质量控制。

作者:戴维斯·麦卡锡

维护者:戴维斯·麦卡锡(Davis McCarthy)

引用(从r内,输入引用(“ spater”)):

安装

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文档

html R脚本 SCATER包装的介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,维度,,,,基因表达,,,,基础设施,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.3),生物酶,,,,GGPLOT2, 方法
进口 Biomart,,,,生物基因,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,EDGER,,,,ggbeeswarm, 网格,林玛,,,,矩阵, 平行,plyr,,,,RESHAPE2,,,,RHDF5,,,,rjson,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,统计tximport,,,,维里迪斯
链接
建议 生物使用,,,,牛仔图,,,,,,,,命运,,,,尼特,,,,单片,,,,mvoutlier,,,,rmarkDown,,,,RTSNE,,,,测试,,,,马格里特
系统要求
增强
URL https://github.com/davismcc/scater
BugReports https://github.com/davismcc/scater/issues
取决于我 斯克兰
进口我 SC3
建议我 switchde
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 scater_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 scater_1.2.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.9(Mavericks) scater_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/scater/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scater/
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