要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“咆哮”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见咆哮.
Bioconductor版本:3.4
确定APA位点的优先使用,比较两种生物学条件,从已知的替代位点和从标准RNA-seq实验中获得的比对开始。
作者:Elena Grassi
维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“咆哮”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“咆哮”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“咆哮”)
R脚本 | 从RNA-seq比对中鉴别APA的使用差异 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(3年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.0.1) |
进口 | 方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/vodkatad/roar/ |
全靠我 | |
进口我 | XBSeq |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | roar_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | roar_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | roar_1.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/roar/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/roar/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |