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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rgsepd。

基因集富集/投影显示

Bioconductor版本:3.4

R / GSEPD是一个生物信息学计划来帮助消除歧义转录组样本(一个矩阵RNA-Seq计数RefSeq IDs)通过自动化微分表达式(DESeq2),然后基因集富集(GOSeq),最后一个n维投影量化方法每个样本就像治疗组。

作者:Stamm卡尔

Stamm维护者:卡尔<卡尔。stamm gmail.com >

安装

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文档

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PDF	R脚本	介绍rgsepd包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,RNASeq,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3.0),DESeq2,goseq(> = 1.17)
进口	gplots,biomaRt,org.Hs.eg.db,GO.db,SummarizedExperiment,哈希,AnnotationDbi
链接
建议	引导、工具、RUnit,BiocGenerics,knitr,xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	rgsepd_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	rgsepd_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	rgsepd_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/rgsepd/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rgsepd/
包下载报告	下载数据