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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅regsplice。

Lasso-Based微分外显子使用的检测方法

Bioconductor版本:3.4

统计方法检测微分RNA-seq使用外显子,外显子微阵列数据集,使用L1正规化(套索)来提高能力。

作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)

维护人员:卢卡斯·m·韦伯< lukmweber gmail.com >

安装

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文档

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browseVignettes (“regsplice”)

PDF	R脚本	示例工作流regsplice包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ExonArray,ExperimentalDesign,微阵列,RNASeq,测序,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于
进口	glmnet,SummarizedExperiment,S4Vectors,BiocParallel,limma,刨边机统计,跑龙套的方法
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lmweber/regsplice
BugReports	https://github.com/lmweber/regsplice/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	regsplice_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	regsplice_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	regsplice_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/regsplice/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/regsplice/
包下载报告	下载数据