##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rTRM”)

此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见rTRM。

PPI网络中转录调控模块的识别

Bioconductor版本:3.4

rTRM从蛋白质相互作用网络中识别转录调节模块(TRMs)。

作者:迭戈Diez

维护人员:Diego Diez

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rTRM”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rTRM”)

PDF	R脚本	介绍rTRM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,GraphAndNetwork,网络,软件,转录
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10),igraph(> = 1.0)
进口	AnnotationDbi,DBI,RSQLite
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,MotifDb,图,PWMEnrich,biomaRt,knitr,Biostrings,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports	https://github.com/ddiez/rTRM/issues
取决于我
进口我	rTRMui
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	rTRM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	rTRM_1.12.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	rTRM_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/rTRM/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rTRM/
包下载报告	下载数据