要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qvalue”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

qvalue

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见qvalue

错误发现率控制的q值估计

Bioconductor版本:3.4

这个包从同时测试许多假设得到的p值列表,并估计它们的q值和局部FDR值。测试的q值测量当特定测试被称为显著性时所产生的假阳性的比例(称为错误发现率)。给定检验的p值,局部FDR测量零假设为真的后验概率。各种各样的图是自动生成的,允许人们做出合理的意义分割。最近,一些数学结果显示了该软件估计q值的保守准确性。该软件可以应用于基因组学、脑成像、天体物理学和数据挖掘方面的问题。

作者:John D. Storey,由Andrew J. Bass, Alan Dabney和David Robinson贡献

维护者:John D. Storey , Andrew J. Bass

引文(从R内,输入引用(“qvalue”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qvalue”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“qvalue”)

PDF R脚本 qvalue包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews MultipleComparisons软件
版本 2.6.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 12年)
许可证 LGPL
取决于 R (>= 2.10)
进口 样条函数,ggplot2、网格reshape2
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL http://github.com/jdstorey/qvalue
全靠我 anotaCancerMutationAnalysisChimpHumanBrainDataDEGseqDrugVsDiseasemetaseqRprot2Dr3CseqSSPAwebbioc
进口我 Anaquinanota冠军clusterProfilerderfinder剂量边缘erccdashboardIHWpapermethylKitmsmsTestsnetresponsenormrRnits风景sRAPsubSeqsynapter触发webbioc
建议我 biobroomLBEmaanovaPREDARNAinteractMAPK
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 qvalue_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 qvalue_2.6.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) qvalue_2.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/qvalue/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/qvalue/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网