要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“quantro”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
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此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见quantro。
Bioconductor版本:3.4
一种数据驱动的测试,使用原始数据,如继承eSets的对象(如ExpressionSet, MethylSet),对分位数规范化的假设进行测试。还必须提供每个样本的组水平信息(如肿瘤/正常状态),因为测试评估的是用户定义的组之间的分布是否存在全局差异。
作者:Stephanie Hicks和Rafael Irizarry
维护人:Stephanie Hicks
引文(从R中输入引用(“quantro”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“quantro”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“quantro”)
R脚本 | quantro用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,测序,软件 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 3) |
取决于 | R (> = 3.1.3) |
进口 | Biobase,minfi,doParallel,foreach,迭代器,ggplot2、方法、RColorBrewer |
链接 | |
建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 纱 |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | quantro_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | quantro_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | quantro_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/quantro/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/ |
包下载报告 | 下载数据 |