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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅QSEA。

IP-seq数据分析和远程化

生物导体版本：3.4

QSEA（定量测序富集分析）作为MEDIPS软件包的继任者，用于分析源自甲基化DNA免疫沉淀（MEDIP）实验的数据，然后进行测序（MEDIP-SEQ）。但是，QSEA提供了几种功能，用于分析其他类型的定量测序数据（例如chip-seq，mbd-seq，cms-seq等），包括计算样品组之间的差异富集。

作者：Matthias Lienhard，Lukas Chavez，Ralf Herwig

维护者：MATTHIAS LIENHARD

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

html	R脚本	QSEA
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	chipseq，，，，芯片奇普，，，，库务，，，，CPGISLAND，，，，DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.0.3
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（0.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 3.3）
进口	生物弦，图形，gtools，方法，统计，utils，hmmcopy，，，，rtracklayer，，，，BSGENOME，，，，基因组机，，，，rsamtools，，，，iranges，，，，林玛，，，，GenomeInfodB，，，，生物基因，grdevices，动物园，，，，生物比较
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，Medipsdata，，，，测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	qsea_1.0.3.3.tar.gz
Windows二进制	qsea_1.0.3.3.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.9（Mavericks）	QSEA_1.0.3.TGZ
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/qsea/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/qsea/
软件包下载报告	下载统计