安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qrqc”)

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qrqc

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qrqc

快速阅读质量控制

Bioconductor版本:3.4

快速扫描读取并收集统计基础和质量频率,读取长度,k-mers位置,和频繁的序列。生产统计图形输出用于质量控制管道,和一个可选的HTML质量报告。S4 SequenceSummary对象允许特定的测试和功能写在收集的数据。

作者:文斯水牛

维修工:文斯水牛< vsbuffalo ucdavis.edu >

从内部引用(R,回车引用(“qrqc”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qrqc”)

文档

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PDF R脚本 使用qrqc包收集信息序列的品质
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,预处理,质量控制,测序,软件,可视化
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase,酿造,xtable,Rsamtools(> = 1.19.38),testthat
进口 重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase、图形的方法,plyr,统计数据
链接 Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://github.com/vsbuffalo/qrqc
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 qrqc_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 qrqc_1.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9(小牛) qrqc_1.28.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/qrqc/tree/release - 3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网