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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qrqc。

快速阅读质量控制

Bioconductor版本:3.4

快速扫描读取并收集统计基础和质量频率,读取长度,k-mers位置,和频繁的序列。生产统计图形输出用于质量控制管道,和一个可选的HTML质量报告。S4 SequenceSummary对象允许特定的测试和功能写在收集的数据。

作者:文斯水牛

维修工:文斯水牛< vsbuffalo ucdavis.edu >

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browseVignettes (“qrqc”)

PDF	R脚本	使用qrqc包收集信息序列的品质
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,预处理,质量控制,测序,软件,可视化
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase,酿造,xtable,Rsamtools(> = 1.19.38),testthat
进口	重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase、图形的方法,plyr,统计数据
链接	Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/vsbuffalo/qrqc
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	qrqc_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	qrqc_1.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9(小牛)	qrqc_1.28.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/qrqc/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/
包下载报告	下载数据