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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见psichomics．

可选剪接量化、分析和可视化的图形界面

Bioconductor版本:3.4

封装具有基于shine的图形界面，用于集成分析来自癌症基因组图谱(TCGA)的替代剪接数据。该工具可交互地执行与TCGA样本相关的临床特征(如肿瘤分期或生存期)的生存期、主成分和差异剪接分析。

作者:Nuno Saraiva-Agostinho [aut, cre]， Nuno Barbosa-Morais [aut, ths]， André Falcão [ths]， Lina Gallego Paez [ctb]， Marie Bordone [ctb]， Teresa Maia [ctb]， Mariana Ferreira [ctb]， Ana Carolina Leote [ctb]， Bernardo Almeida [ctb]

维护者:Nuno Saraiva-Agostinho < nnodanielagostinho at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	命令行界面教程
超文本标记语言	R脚本	自定义替代拼接注释
超文本标记语言	R脚本	可视化界面教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing，BiomedicalInformatics，DifferentialSplicing，GUI，MultipleComparison，PrincipalComponent，RNASeq，测序，软件，生存，转录，转录组，可视化
版本	1.0.8
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (>= 3.3)，闪亮的(> = 1.0.0),shinyBS
进口	AnnotationHub，data.table，消化，dplyr，DT(> = 0.2),fastmatch，highcharter(> = 0.5.0),httr，jsonlite，miscTools，plyr，R.utils，shinyjs，stringr统计数据,生存，寿司，工具，utils，XML、方法
链接
建议	testthat，knitr平行,devtools，rmarkdown，gplots，covr，车
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/nuno-agostinho/psichomics
BugReports	https://github.com/nuno-agostinho/psichomics/issues
全靠我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	psichomics_1.0.8.tar.gz
Windows二进制	psichomics_1.0.8.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	psichomics_1.0.8.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/psichomics/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/psichomics/
软件包下载报告	下载数据